Режим особой охраны территории национального парка включает систему правил и мероприятий, необходимых для выполнения стоящих перед ним задач и устанавливается, исходя из целей создания национального парка и требований законодательства РФ в области охраны окружающей среды.
На территории национального парка установлен дифференцированный режим его охраны, защиты и использования с учетом местных природных, историко-культурных и социальных особенностей согласно которому выделены функциональные зоны. Охрана территории национального парка осуществляется государственными инспекторами национального парка (43 единицы).
Отдел охраны подразделяется на службу охраны озера, службу охраны леса, егерскую службу, службу охраны дендросада. Отдельным подразделением является служба охраны ГПЗ ФЗ «Ярославский».
Маршруты патрулирования: Купанское лесничество, Пригородное лесничество, дендросад, лес, лес 28-40, заказник «Ярославский», озеро Плещеево.
С целью усиления охраны природных комплексов и объектов и контроля за соблюдением установленного режима и иных требований природоохранного законодательства из состава госинспекторов сформирована постоянно действующая мобильная группа из 7 человек. Государственные инспекторы национального парка оснащены, служебным оружием, средствами мобильной связи и рациями,
Для целей охраны приобретены:
Регулярное патрулирование территории и проведение оперативных рейдов на территории парка силами всего инспекторского состава службы охраны позволяет постоянно вести наблюдение и оперативно реагировать на возникающие нарушения природоохранного законодательства на территории национального парка и его охранной зоны. Периодически к охране территории национального парка привлекаются работники правоохранительных органов.
Для более эффективной организации охраны на территории национального парка вводятся специальные режимы и ограничения: нерестовые периоды - запрет вылова рыбных ресурсов из озера Плещеево; пожароопасный период - ограничения или полный запрет на посещение лесов национального парка.
Система сформированных методов по обеспечению режима особой охраны территории национального парка позволяет выявлять большое количество правонарушений, прогнозировать и предупреждать их.
1. Ежедневное патрулирование территории (лес, озеро, охранная зона) с целью выявления нарушений режима НП.
2. Подкормка диких животных 3 раза в неделю.
3. Мониторинг численности диких животных:
4. Проведение проверок соблюдения природоохранного законодательства на территории НП и его охранной зоны.
5. Отбор проб воды и замер уровня озера (еженедельно).
6. Установка шлагбаумов и аншлагов.
7. Сбор данных по вылову рыбы рыболовами (ежемесячно).
Мероприятия по охране территории национального парка включают в себя:
Результатами охранных мероприятий на территории национального парка и его охранной зоны являются:
Службой охраны на территории национального парка установлено 150 информационных, противопожарных и запрещающих аншлагов.
Для ограничения въезда установлено 40 шлагбаумов.
Егерская служба проводит охранные и биотехнические мероприятия (подкормку и учёт диких животных в течение года).
Госинспектора также проводят проверки по соблюдению природоохранного законодательства на территории национального парка и его охранной зоны.
Из госинспекторов отдела охраны сформированы четыре пожарных подразделения. Подразделения укомплектованы пожарными машинами, мотопомпами, ёмкостями для воды, ранцевыми огнетушителями, топорами, лопатами и т.д.
Проведено обучение и проверка знаний госинспекторов по тактике и технике тушения лесных пожаров.