Национальный парк «Плещеево озеро» основан в 1988 как Переславский государственный природно-исторический национальный парк, в соответствии с Постановления Совета Министров РСФСР от 26 сентября 1988 года №400 «О создании Переславского государственного природно-исторического национального парка в Ярославской области», и решения Малого Совета Ярославского областного Совета народных депутатов 21-го созыва от 27 мая 1993 года №118 «Об особо охраняемых природных территориях Ярославской области» для использования его в просветительских, рекреационных, научных и культурных целях.
На основании Постановления Правительства Ярославской области № 270-п от 24.12.97 г. Правительство Российской Федерации рассмотрело Ходатайство и Постановлением от 17 июля 1998 г. № 777 «О национальном парке «Плещеево озеро» постановило принять предложения администрации Ярославской области и Федеральной службы лесного хозяйства России об отнесении Переславского государственного природно-исторического национального парка к особо охраняемой природной территории федерального значения и переименовании его в национальный парк «Плещеево озеро».