По решению Министерства природных ресурсов и экологии Российской Федерации ФГБУ "Национальный парк "Плещееово озеро" осуществляет охрану территории государственного природого заказника федерального значения "Ярославский", а так же мероприятия по сохранению биологического разнообразия и поддержанию в естественном состоянии охраняемых природных комплексов и объектов на территории данного заказника. Заказник "Ярославский" находится на расстоянии около 180 км от ФГБУ "Национальный парк "Плещеево озеро".
Цели создания: охрана типичной и уникальной фауны, а также как резерват охотничьей фауны, способствующей расселению диких животных. Среди охраняемых объектов более 40 видов млекопитающих (среди прочих – выхухоль и бобр) и 200 видов птиц (в том числе орлан-белохвост).